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in silico biology's

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パターン検索

この機能は以下のソフトウェアに搭載されています

IMCSE

IMCGE

IMCAE

GT

機能

塩基配列あるいはアミノ酸配列のパターンを検索する機能。

IUPACコードによるあいまい検索が実行できます。

配列パターン登録

登録済みパターンからパターンを直接入力(コピーアンドペースト)

配列種類指定(核酸配列、アミノ酸配列)

探索するStrand指定

ミスマッチ検索

領域指定探索(遺伝子上、遺伝子間領域、遺伝子上流・下流指定塩基以内)

検索結果から該当パターン位置のフィーチャーマップを直接表示

検索結果をフィーチャー登録

検索結果をファイル保存(CSV形式、FastA形式)

複数ゲノムの同時検索

より詳しく

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