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I05 PM01: プラスミドマップ上の特定のフィーチャーを別の色で描画する

 

描画例

 

~ imcimgI05/IMC5204_C806_0031.png

使用するソフトウェア

 

  • IMC GE/AE
  • GT

 

操作方法

 

  1. カレントmain配列フォルダーにプラスミド地図を描画するプラスミド配列をロードします。
  2. その配列ノードをクリックします。
    • その配列がカレント配列になり、MainFeatureMap上に描画されます。
  3. 異なる色で表示したいフィーチャー上でマウス右クリックします。
    • メニューが表示されます。
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0037.png,50
  4. Set Qualifier --> Colorをクリックします。
    • カラーパレットが表示されます。
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0036.png,50
  5. 任意のカラーを選択し、Setボタンをクリックします。
    • そのフィーチャーが指定したカラーで描画されます。
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0038.png
  6. 指定されたカラーで描画されない場合は、メインフィーチャーマップのカラーボタンFKをクリックします。
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0039.png
    • カラーボタンがFKからQに切り替わり、そのフィーチャーの描画色が指定した色になります。
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0040.png
  7. MenuからCloning --> PlasmidMapを選択します。
    • 確認メッセージが表示されます。
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0025.png
  8. はいをクリックします。
    • カレント配列(Plasmid)に異種の挿入DNA配列がライゲーションされている場合にはSelectInsertDialogが表示されます。
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0026.png
  9. 異種挿入配列領域を選択します。
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0027.png
  10. Setボタンをクリックします。
    • Plasmid Map Viewerが表示されます。
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0033.png,50%
  11. Plasmid Map Layout StyleからDefault Setを選択し、Setボタンをクリックします。
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0032.png
    • Insert DNAとPlasmid Regionにデフォールトレーンが表示されます。
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0034.png,50%
  12. + Insert DNAに表示されたレーンにチェックし、Editボタンをクリックします。
    • Insert Lane Style Setting Dialogが表示されます。
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0013.png
  13. カラーボタンFKが表示されている場合はそれをクリックします。
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0015.png
    • カラーボタンがカラーボタンQに変わります。
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0014.png
  14. Setをクリックします。
  15. Drawをクリックします。
    • Insert DNA上のカラー設定フィーチャーが設定された色で描画されます。
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0017.png
  16. 同様にPlasmid Regionに表示されたレーンにチェックし、Editボタンをクリックします。
    • Circular Lane Style Setting Dialogが表示されます。
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0018.png
  17. カラーボタンFKが表示されている場合はそれをクリックします。
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0015.png
    • カラーボタンがカラーボタンQに変わります。
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0014.png
  18. Setをクリックします。
  19. Drawをクリックします。
    • Plasmid Regionに上のカラー設定フィーチャーが設定された色で描画されます。
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0022.png,50

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