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New Generation Sequencer Data Analysis

Various NGS indluding Solexa, SOLiD and 454, data analysis tools are provided. These tools can handle numerous number of short reads generated from these next generation sequencers such as Illumina, Applied Biosystems and Roche. These tools are mainly implemented on GenomeTraveler. MetaGenomeGAMBLER also provides some of such tools.

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# Article Title Author Hits
1 NGSフラグメントショートリードの参照ゲノムへのマッピング GT Developer 2709
2 ペアエンド配列の参照ゲノムへのマッピング Administrator 2856
3 Short Readのマッピング結果からSNPsを検出する Administrator 2612
4 参照ゲノム全域にわたるCoverage DepthをCSV形式でファイル出力する Administrator 2544
5 ABI SOLiDのカラースペース(CSFastA)で記述された配列ファイルを参照ゲノムにマッピングする Administrator 2861

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