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ソリューション

インシリコバイオロジー社のソフトウェアを使用して実現できる先進的かつユニークなソリューションを多数掲載しています。このソリューション記述においては製品を特定しません。どのような課題に対して、主としてインシリコバイオロジー社の製品がどのような解決方法を提供できるかを述べています。したがって、あるソリューションについては、1つの製品ではなく、外部ソフトウェアあるいは手作業を含めた総合的な解決方法を記述しています。

  • 相同性解析   ( 1 記事 )

    Blast等を利用した相同性検索は、配列解析において、様々なソリューションを提供しています。ここでは、インシリコバイオロジーが相同性解析機能を利用して、実現しているソリューションを紹介しています。

  • クローニングin silico   ( 21 記事 )

    IMCでは制限酵素によるDNAの断片化、PCR増幅、ライゲーション、ゲル電気泳動などの一連のクローニング実験をシミュレートできます。これを「インシリコクローニング」実験と呼んでいます。これらのクローニング実験は環状DNAに対応しています。すなわち、環状ゲノムの任意の部位で継ぎ目なくクローニング実験が可能です。また、この機能はGenomeTravelerにも実装されています。

  • ゲノムアノテーション   ( 11 記事 )

    ゲノムに注釈づけ(アノテーション)するための、手動、あるいは自動ツールを提供しています。

  • 比較ゲノム   ( 9 記事 )

    2種類以上の近縁種(株)同士を比較するための解析ツールを提供しています。比較ゲノム機能はIMC Genomics Edition、Array EditionおよびGenomeTravelerに実装されています。

  • アレイ解析   ( 2 記事 )

    IMCのアレイ解析はタイリングアレイあるいは位置特異的アレイ解析用です。しかし、一般の遺伝子発現アレイでもプローブ配列あるいはプローブ位置情報があれば使用できます。アレイ解析はIMC Array Edition で提供されています。また、GenomeTravelerにおいては、IMC Array Editionの全機能が搭載されています。

  • 次世代シーケンサデータ解析   ( 5 記事 )

    Solexa(Illumina), SOLiD(ABI of LifeTech), 454(Roche)などの次世代シーケンサから出力される多量のショートリード配列の解析ツールを提供しています。この機能は主として、GenomeTravelerが提供していますが、MetaGenomeGAMBLERでも実行可能です。

  • マッピング   ( 6 記事 )

    参照ゲノム塩基配列上にそれらから由来する塩基配列(次世代シーケンサから出力されるショートリードを含む)あるいはアミノ酸配列などをマッピングし、フィーチャーとして登録することができます。EST配列マッピング、アミノ酸配列マッピング、トレース波形データマッピング、SNPsマッピング、プローブマッピング、次世代シーケンサ配列マッピング、SOLiD マッピング、Solexaマッピング、454マッピング、などが実装されています。

  • アセンブル・スキャフォールディング   ( 2 記事 )

    DNA断片配列をアセンブルしたり、多量のコンティグをペアエンド配列を利用して自動的に結合し、スキャフォールドを生成する機能などを提供しています。

  • 可視化ビューア   ( 8 記事 )

    ゲノムを可視化するためのいろいろなビューアを提供しています。それぞのビューア上では、マウスによりで簡単で直感的な操作を実現しています。

  • パスウェイ解析   ( 3 記事 )

    アノテーションがある程度進んだ段階では、そのゲノムに存在するパスウェイを予測してパスウェイマップを描画することができます。IMCやMGGでは、ECNumberが同定された遺伝子について、KEGG Pathwayを利用して、局所的なパスウェイマップを描画します。

  • 塩基配列・アミノ酸配列の入手・操作・解析・書出し   ( 2 記事 )

    目的の塩基配列およびアミノ酸配列の入手、操作、解析、書出しなどを行う一連のソリューションを記述します。

  • 検索機能   ( 16 記事 )

    配列や注釈を対象とする様々な検索機能を提供しています。また、検索結果から連続して、次の操作を実行することも可能です。

  • トラブル・エラー発生時の対処方法   ( 7 記事 )

    ソフトウェアを使用中に発生するトラブルの解決方法について説明します。

  • インポートとエキスポート   ( 1 記事 )

    外部ファイルの取り込み、およぶ他のソフトウェア用の書き出し機能です。

  • B フィーチャーマップの表示と操作   ( 4 記事 )

    配列とフィーチャーをフィーチャーマップ上に表示する機能です。メインフィーチャーマップは、複数のレーンから構成され自由にカスタマイズすることが可能です。

  • A ワークベンチ   ( 3 記事 )

    IMC WorkBenchの機能と操作方法について説明します。

近日中リリース予定製品

近日中リリース予定機能