Get Adobe Flash player
Home 案内板
English (UK)

検索機能への案内

フィーチャーキー検索

  • この機能は以下のソフトウェアに搭載されています
    • IMCSE
    • IMCGE
    • IMCAE
    • GenomeTraveler
  • 機能
    • 指定したFeature Keyに属する全Featureあるいは指定範囲内のFeatureをリストアップします。
    • 検索されたFeatureリストから直接その部位のフィーチャーマップを表示します。
    • Strand別のフィーチャー数をカウントします。
    • Annotation/Description Windowの直接起動
    • 検索されたフィーチャーに属する核酸配列、アミノ酸配列(CDSのみ)を取り出せます。
    • 検索リストからは様々な操作が可能です。
    • 複数ゲノム配列を同時に検索できます。
    • 外部サーバでの相同性検索用のクエリー配列を生成します。

より詳しく

パターン検索

  • この機能は以下のソフトウェアに搭載されています
    • IMCSE
    • IMCGE
    • IMCAE
    • GenomeTraveler
  • 機能
    • -塩基配列あるいはアミノ酸配列のパターンを検索する機能。IUPACコードによるあいまい検索が実行できます。
    • 配列パターン登録
      • 配列パターンの直接入力による登録
      • 登録済みパターンから
      • パターンを直接入力(コピーアンドペースト)
      • 配列種類指定(核酸配列、アミノ酸配列)
      • 探索するStrand指定(両Strands、Forward Strandのみを検索する、Reverse Strandのみを検索する)
      • ミスマッチ検索(Exact Match、One Base Mismatch、Two Base Mismatch、CDS/RNA上のアミノ酸配列検索)
      • 領域指定探索(遺伝子上、遺伝子間領域、遺伝子上流・下流指定塩基以内)
      • 検索結果から該当パターン位置のフィーチャーマップを直接表示
      • 検索結果をフィーチャー登録
      • 検索結果をファイル保存(CSV形式、FastA形式)
      • 複数ゲノムの同時検索

より詳しく