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マッピング

参照ゲノム塩基配列上にそれらから由来する塩基配列(次世代シーケンサから出力されるショートリードを含む)あるいはアミノ酸配列などをマッピングし、フィーチャーとして登録することができます。EST配列マッピング、アミノ酸配列マッピング、トレース波形データマッピング、SNPsマッピング、プローブマッピング、次世代シーケンサ配列マッピング、SOLiD マッピング、Solexaマッピング、454マッピング、などが実装されています。

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# 記事タイトル 日時 作者 参照
1 ABI/SCF形式のトレースデータを参照ゲノム塩基配列上にマッピングする 2010/11/14 IMC Developer 2142
2 次世代シーケンサ塩基配列(454,SOLiD, Solexa)を参照ゲノム塩基配列上にマッピングする 2010/10/26 Administrator 4215
3 アレイプローブ配列を参照ゲノム配列上にマッピングし、プローブフィーチャーとして登録する 2010/10/26 Administrator 1764
4 SNPs塩基配列を注釈付きで参照ゲノム配列上にマッピングする 2010/10/26 Administrator 1964
5 アミノ酸配列を参照ゲノム上にマッピングし、エクソンとイントロンを区別してフィーチャーとして登録する 2010/10/26 IMC Developer 2310
6 EST(cDNA)塩基配列を参照ゲノム配列上にマッピングする 2010/10/26 Administrator 2236