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次世代シーケンサデータ解析

Solexa(Illumina), SOLiD(ABI of LifeTech), 454(Roche)などの次世代シーケンサから出力される多量のショートリード配列の解析ツールを提供しています。この機能は主として、GenomeTravelerが提供していますが、MetaGenomeGAMBLERでも実行可能です。

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# 記事タイトル 日時 作者 参照
1 NGSフラグメントショートリードの参照ゲノムへのマッピング 2011/06/13 GT Developer 2222
2 ペアエンド配列の参照ゲノムへのマッピング 2011/01/26 Administrator 2313
3 Short Readのマッピング結果からSNPsを検出する 2011/01/26 Administrator 2068
4 参照ゲノム全域にわたるCoverage DepthをCSV形式でファイル出力する 2011/01/26 Administrator 2072
5 ABI SOLiDのカラースペース(CSFastA)で記述された配列ファイルを参照ゲノムにマッピングする 2011/01/22 Administrator 2414